Kontrol sistemi dikey işleme merkezinin temel bileşenidir. Operatör komutlarını alır ve çeşitli makine bileşenlerinin hareketini kontrol eder. Kontrol sistemleri genellikle yüksek-hassasiyetteki CNC sistemlerini kullanır ve karmaşık işleme yollarına ve hassas konumlandırmaya olanak tanır. Kontrol sisteminin hassas kontrolü sayesinde dikey işleme merkezleri yüksek-hassas işleme elde edebilir, bu da üretim verimliliğini ve kalitesini önemli ölçüde artırır.
